上月由香（椎名碧流 配音）是一名职业跳伞师，她的工作是确保客人们在进行跳伞运动时的人身安全。表面上看，由香的外表清新个性甜美，但是在这样的外表下，却隐藏了一个惊天秘密。由香的体内隐藏着怪物的基因，每当情绪激动时，这基因便会使由香变异成外表可怖的食人鬼，而由香无法控制食人 鬼的所作所为，很多人成为了她手下的牺牲品。在工作中，由香结识了性格老实正直的桃田俊彦（木内秀信 配音），两人一见钟情。可是，俊彦...

故事以前作《科学小飞侠Crowds》的后续剧情展开。距离“立川事件”已经过了一年，当初贝尔库·卡切赋予尔乃美家累的力量“CROWDS”在日本首相菅山的推广之下已在人类社会当中广泛普及。然而仍然存在着对此感到不满的人们，此时菅山遭到不明人士的袭击，GATCHAMAN的全新战斗就此揭开序幕。...